最为重要的原因便是嘉靖没有让他干脏活，而且他平时也非常会为人处世。虽然吕芳也是嘉靖的人，也跟严嵩合作过，但是他和裕王没有深仇大恨。他在宫里面也没有像陈洪那样四处树敌。无论以裕王为首的清流、司礼监、还是严党，都对吕芳尊敬有加的。后来，吕芳认准的时机，及时的向裕王靠拢，加上嘉靖的顾及主仆情谊，吕芳得以善终。
经过多年的发展，再朝中形成了"严党"派系，威胁了嘉靖皇帝自己的权势，而且嘉靖皇帝也未尝没有打压的意思，为继任者上位做准备。所以通过手段把严嵩弄到未来皇帝的对立面上，那么严嵩事不倒也要倒了。一朝天子一朝臣，未来的皇帝肯定会有自己的班底，严嵩如果不倒，这对于将来的皇帝的权威是一个巨大的阻碍，所以嘉靖皇帝不得不这么做。
