另一方面太平天国自身有很多问题，而石达开在出走之后始终坚持反清，对清作战。最终他被俘，慷慨身亡，也保持了农民革命英雄的本色。生前用兵神出鬼没，死后依然令敌人畏惧，甚至于在他去世后的数十年都有人打着他的旗号反清。关于石达开的传说更是遍布他战过的大半个中国，所以，他不是完美的英雄，但也不是一心为个人利益的无耻小人。
最后走上绝境，他希望一人而自刎，全三军以投安。然而清军转头将他的部下几乎杀尽，所剩只有三百老幼。同治二年（1863年）6月27日，石达开在公堂受审，大义凛然，说的主审官词穷。最后从容就义，身受凌迟酷刑，足足被割了一千多刀，却没喊一声。无疑，他是一个无畏的英雄，根据记载来看，他的几位妻子在其去世后也选择了投河自尽。
不过还剩了一位石定忠，五岁的孩子当时跟着父亲谈判，他的下场最后也不好。据说，按照大清的律法，凌迟的年纪最少要到十岁，可石达开只有五岁。便有人建议说，养到十岁再凌迟，不过最终没等到凌迟，在父亲身亡后不久，石定忠也被残忍杀害。而太平天国也走向了末路，1864年7月19日天京失守，清屠城。
年幼的洪天福贵被人抱出，这位相较石定忠更为可怜，他当时已满十五岁。到了可以实行凌迟的年纪，这个一心想去湖南读书做秀才，想20岁再娶妻的年轻人死在了十六岁那年，以凌迟这样残酷的刑罚。1872年4月，石达开部下李文彩在贵州覆灭，这是最后一支太平军，轰轰烈烈数十年，太平天国以这样的方式走向结束。
