双重压力下清朝廷慌了，他们需要尽快控制住疫情，但是派谁去接这个"烫手山芋"呢。又要懂医又要懂得与外国人交涉。当大家都发愁的时候，时任外交部长施肇基举荐了一位人才。此人名叫伍连德，是马来西亚归国华侨，24岁便获得剑桥医学博士学位的华人，诺贝尔奖获得者，外国医学专家对其医术赞誉有加，能力毋庸置疑。在施肇基的举荐下，他被封为"大清防疫总医官"连夜出发奔赴哈尔滨。
伍连德的能力在到达哈尔滨后很快就体现出来，当时他要做的是确认病源，最简单的方法就是解剖尸体。但说起来容易，做起来却难如登天。由于当时人民思想封建，讲究死者为大入土为安。人民极力阻止伍连德解剖研究尸体，当时伍连德拗不过封建的人民，决定悄悄进行研究，却险些被激进的人民夺去性命。就在事情僵持不下之时事情出现转机，一位日本女子染病身亡，伍连德抓住机会征得日本人同意，解剖了日本女子的尸体，抓紧一切时间做实验观察，结果令他心惊，竟是鼠疫。
为了杜绝传染源，官府下令捕杀城中所有老鼠。但情况却越来越糟，感染死亡人数不减反增，伍连德解剖老鼠尸体，发现老鼠身体中并不存在鼠疫杆菌，证明传染源不是老鼠。伍连德突然想到一个细节，那个日本女人是与一位皮毛商人同住的，商人主要贩卖的是旱獭皮，开始死去的两个猎户他们卖的也是旱獭皮，而旱獭也具备携带病菌的能力。原来这场鼠疫的真正发源地不在哈尔滨而是沙皇俄国。
