但是，这些倭寇是不是真的是汪直引来的呢？这个结论在史学界一直有争议。因为第一个断定此次入侵的倭寇是汪直召来的，是当时的总督大人胡宗宪。胡宗宪法判断的理由也很简单，因为''胡公前按浙时，见贼进退纵横皆按兵法，知必有坐遣者。且贼酋来者，皆直部落也，而不闻直来，其为坐遣无疑''。
胡宗宪的判断不能说是空穴来风，但也有证据不足的嫌疑。胡宗宪判定倭寇与汪直勾结，有两个理由：一是这些倭寇是有组织的，二是有一部分倭寇打的是汪直的旗号。胡大人从这两点判定汪直是元凶，只不过仅仅是在逻辑上有点道理而已，实际上并不证据。而据一直在胡宗宪手下的张海鹏的《借月山房汇钞》记载，这些倭寇只是诡称是''某岛之夷''，并不是都打着汪直的旗号。
根据《汪直传》我们知道，汪直从来不会直接参与倭寇的抢劫行为，特别是他自称''静海王''之后，更是不可能以身犯险，去参加这种简单粗暴的抢劫。他本人没有参加倭寇，倭寇的抢劫也没有证据是汪直安排的，所以断定汪直是倭寇，确实有点牵强。
明代著名科学家徐光启曾对如何处置汪直提出过自己的建议：''汪直向居海岛，未尝亲身入犯，招之使来，量与一职，使之尽除海寇以自效。''从他的话中，我们也可以看出，徐光启也是认为汪直没有做过倭寇的。所以他才建议招安汪直，利用汪直除掉海寇。
