秦琼加入瓦岗寨以后和多次击败隋军，还迫使隋朝政府免去了他们的罪行，这个时候秦琼想解散了瓦岗寨，然后回到杨林的身边，这时李世民却来到了瓦岗寨，他与秦琼秘密谈了一整夜。他告诉秦琼现在隋炀帝开挖运河，远征高丽劳民伤财，隋朝灭亡的趋势已经定了，与其跟随杨林为隋朝卖命，不如继续作为反王说说不定还能救下更多的人，秦琼听着很有道理便接受了。
又过了几年，隋朝被众多反王逼的只剩下江南之地，杨林为了救隋朝设下了毒计，他让皇帝骗反王去比武。承诺谁获得第一名便被授予兵马大元帅一职，然后在武场里面埋上了很多的炸药，还埋伏了很多的精兵，本想着将这些反王全都炸死，没想到计划却暴露了，然后他命丧与此。消息传到了瓦岗寨，秦琼非常的痛苦，他在自己的家里为杨林披麻戴孝。
