说到朱褒叛乱的原因，不得不提一提诸葛亮的一次重大失误。据《三国志后主传》载，朱褒担任牂牁太守期间，曾经派遣益州从事常房前去当地视察。常房得知朱褒有反叛之心，便将该郡的主簿抓来严刑拷打，想获得朱褒谋反的证据。结果不但证据没找到，反而将这名主簿活活打死。此举引发朱褒的强烈不满，一怒之下将常房杀死，又向诸葛亮举报常房作乱。
此时，诸葛亮的做法令人费解。他不但没有派人进行详细调查，反倒将常房的儿子全部处死。按照这个处理，似乎说明常房是罪有应得。但据《三国志后主传》注引《魏氏春秋》载，诸葛亮又做了一件出人意料之事。该传称，在处死常房的几个儿子后，诸葛亮不但将常房的四弟赦免，还将其迁到越西一带保护起来。
从这个记载来看，诸葛亮的决策可谓前后矛盾。将所有的线索综合起来梳理，事实的真相应该是这样的：刘备病逝后，南中地区局势更为混乱。此时担任牂牁太守的朱褒也心生反意，但并没有具体行动。而被诸葛亮派去视察的常房拷问并打死了主簿，从而将矛盾激化。
