皇太极
首先，后金天聪五年（1631年）皇太极在议定六部时，规定每一部都要有蒙古承政，同时提高漠南蒙古贝勒的地位，仅次于八旗贝勒。其次，皇太极采取了满蒙联姻的政策来拉拢漠南蒙古，使其为后金政权效力。这一时期满蒙联姻的情形十分普遍，清代的"备指额驸"便是其后期的产物。再次，针对满、蒙两族不同的民俗风俗，皇太极不仅没有勒令漠南蒙古遵守满洲习俗，反而对其十分宽容，采取"不易其俗"的态度。漠南蒙古信奉喇嘛教，皇太极便用三年时间建成"莲花净土实胜寺"，在此供奉嘛哈噶喇佛。此外，为了加强对漠南蒙古的管理，崇德元年（1636年）皇太极设立了统管蒙古事务的理藩院，还设有专门管理蒙古事务的蒙古衙门，与六部平行，组建皇太极对漠南蒙古的重视。
为了保持漠南蒙古地区的长久稳定，皇太极在当地推行了重要的改革，主要表现为划定牧地。但是皇太极在划定牧地时，十分重视对蒙民的影响，不仅维持了各部落原有的牧地疆界，而且在划定新的牧地时充分考虑到了原部落间的血缘、地缘关系。同时，在划定牧地的过程中清查了居住于此的牧民户数，对当地的牧民情况有了充分的了解。
皇太极像
在后金四处征战的过程中，如何让归顺的蒙古各部听命于己，是皇太极极为重视的问题。为了控制蒙古军队，皇太极采取了几项措施整编蒙古军队，将军事指挥权控制在自己手中。首先是在蒙古各部中推行后金的各项法律法规，将他们都约束在清朝法制之下，以让他们能够完全听命。此外，皇太极还多次召集蒙古各部王公大臣重新立法、订约。其次，实行会审制度，由蒙古衙门专门调遣蒙古各部军队，皇太极将满洲八旗制度推行于蒙古地区，建立了扎萨克旗。再次，制定严格的赏罚制度，对不服从命令、肆意行动者，严加责备。正是在皇太极的治理下，漠南蒙古地区保持了长期的稳定。
