恩琴攻入城中后开始血洗库伦。他不改从前暴力血腥的手段，没有撤退的北洋驻军和一些政务官员都被恩琴的骑兵师屠杀殆尽，大约共有4000人。就连逃离恩琴统治的蒙古难民也曾说过："死神之善良亦多于男爵"，也证实了恩琴的残忍可怖。
恩琴攻占库伦后自封亲王。在占领屠杀之后，不是蒙古人的恩琴却成为了外蒙古实际上的统治者。疯狂的他，毫无管制国家的概念，不仅对宗教领袖随意羞辱，为了筹措军费，还会将库伦居民毫无理由地关进监狱里，逼迫其家人拿钱赎人。
身为沙俄的贵族却信奉藏传佛教，推行反蒙古的政策，不停地扩张军队、购买武器，妄图重建王朝。消灭4000人后他还自封为外蒙古亲王，宣布独立建国，成为了整个外蒙古军队口中的"开国大巴图鲁司令"。
恩琴滥杀无辜，最终兵败于苏联。恩琴的暴虐不断摧残着蒙古首领的心，不堪重负的蒙古宗教首领哲布尊丹巴无数次地求援于北洋政府皆是无果，便也逐渐对中国内陆政府冷了心，这也是造成蒙古独立出中国的一个重要因素。
