关于孝宗生母纪氏的死，史传不一，有人说她是被万贵妃派人毒死的，有说是被万贵妃派人暗杀的，还有说她是为避免万贵妃的迫害而上吊自尽的。不管哪一种说法，万贵妃都是其中的关键人物。正因为如此，所以朝臣们都把矛头指向了万贵妃及其党羽，并提出要效法历史上削谥号的先例，将蒙骗宪宗、扰乱朝纲的万贵妃谥号"恭肃端慎荣靖皇贵妃"削去。
朝臣们的奏疏说得都是实情，请求削去万贵妃的谥号也合情合理。当然，孝宗也不是圣人，他内心十分痛恨杀害自己生母的仇人万贵妃，所以他很想接受朝臣的建议，大笔一挥，削去万贵妃的谥号，将万氏一族治罪。
但孝宗毕竟是一位有主见的皇帝，他转念一想，觉得这样做似有不妥，如果按照朝臣的奏疏追查起来，势必牵连甚广，而且又必然牵扯到宪宗皇帝的诸多失德之事；二是追查起来有悖于儒家的"父为子隐、子为父隐"的道德准则；三是宪宗皇帝生前专宠万贵妃一人，如果削去她的谥号，不仅会违背宪宗皇帝的意愿，而且还将涉及明朝的一些典章。
经过这一番考虑后，孝宗最终还是放下了个人恩怨，采取息事宁人的态度，以"违先帝之意"为由，下令不再深究万贵妃，由此，万氏家族才侥幸逃过这一劫。
由于孝宗在处理万贵妃这件事上采取了克制、宽容的态度，所以他备受人们的赞誉。在他死后，人们给他的庙号加上了一个"孝"字，称为为"孝宗"，看来，孝宗朱佑樘的这个"孝"字，里面确实隐含了大学问、大气魄。
