既然南朝宋与南宋都是从前朝手中继承的国家，南朝宋开国皇帝刘裕还曾南征北战，收复了关中、河南、山东等地，为何南朝宋的国祚会比南宋短近百年？归纳起来主要有如下几个原因：
1、政治原因
刘裕一生南征北战，为南朝宋的建立奠定了坚实的基础。但其英年早逝，仅仅两年的在位时间无法进一步解决南朝宋所面临的许多问题，原本对北魏的北伐也因其去世而搁浅。刘裕开创的寒门政治并未以制度形式确立，因而稳定性较差，宋少帝为众臣所废，宋文帝为子所弑，前废帝、后废帝均被弑废，明帝继位后又带领文帝系诸王与孝武帝系诸王展开宗室内战，虽然人口和领土不及刘子勋控制下十分之一的明帝最终凭借自身团结和兵力精锐击败了刘子勋，但也因此引起徐州刺史薛安都的怀疑，最终因"泰始之祸"丧失大部分淮北领土，扭转了南强北弱的局面（也有说法称南强北弱局面早在第二次元嘉北伐便被扭转）。而且行政制度也尚未成熟。
相比较而言，南宋时经过隋唐三省六部制的确立与完善，北宋二府三司的建立和"收精兵、削实权、制钱谷"举措，行政制度相对于南朝宋而言更成熟，群臣间权力相互制衡，中央在与地方分权的斗争中处于绝对上风，相对于南朝宋而言更能保障政权的平稳运行。
