至于崇祯皇帝的另外两个儿子定哀王朱慈炯和永悼王朱慈炤，跟太子朱慈烺的命运，也是在北京城被李自成攻破的时候，被李自成抓到军中。后在李自成与吴三桂的战斗中，也在乱军之中失踪。
不过后来清朝统治时期，民间多次出现"朱三子案"，也就是民间打着朱三子的旗号反对清廷的统治。也因为经常发生这样的事件，所以在公元1708年，化名为王士元的永王朱慈炤被清廷发现，虽然他此时已经是75岁高龄，并力辩自己根本无"反清复明"之念，但还是惨遭清朝杀害。而他在南明的那段时期，一直在逃命，自己的性命尚不能保证，又怎么能领导南明政权呢？
历史上就是这样，因为没有崇祯的继承人领导南明政权，导致南明政权四分五裂，各自为政。最终南明政权集体消逝在历史的尘烟中，如果崇祯的儿子能够领导南明政府，历史或许会有新的发展，但历史就是没有如果。
