然而，准噶尔汗国毕竟不是罗卜藏丹津，而此时的悍将年羹尧也已被赐死，清军的优势也并不明显。
雍正九年，清军领军大将傅尔丹被对方奸细所骗，在和通泊一带被准噶尔军击败，四万大军几乎全军覆没。不过一年之后，在额尔德尼昭（光显寺）额驸策凌率领清军又给准噶尔军来了一个反包围，击杀万余准噶尔军。
双方经此两战，都是元气大伤，财力、人力都很吃力，最终彼此议和罢兵，清朝虽然很不爽，但一时半会，还真奈何不了人家。
直到乾隆十年，噶尔丹策零身死，准噶尔内部为了夺取汗位，互相征伐，接连换了几个大汗都相继被杀，内乱愈演愈烈，清朝这才看到了机会。
