其一、他书生意气太浓，有些自大。自从朱标死后，朱元璋就知道自己以前所有的构想都得打乱重来，以前太子地位稳固，能力出众，能完全掌控局势。可换了皇太孙后就不一样了，因为担心君弱臣强，老朱家江山不稳，他开始大肆清洗元勋武将。
在立皇太孙前，特意把冯胜、傅友德、蓝玉调出京城巡边，随后突击立了朱允炆为皇太孙，然后迅速清除了利益最相关的蓝、常两家势力，后来又先后赐死冯胜、傅友德，几乎为朱允炆当皇帝做好了一切工作，可以说朱允炆当上皇帝后什么都不用干，只按照朱元璋的布局做皇帝就行了。
可惜朱允炆书生意气太浓，考虑事情只出于理论，总想迅速实现自己的"施政纲要"，并且有些自大，对局势分析估计不足，不相信朱元璋生前留给他的政治布局，非要推倒重来，结果适得其反，让矛盾迅速激化。
其二、急切变更祖制，心狠手辣。在削藩问题上，朱允炆有些太急于求成，而且心狠手辣。朱元璋刚死，就急吼吼地变更祖制，强行削藩，而且颇有些心狠手辣。连废四个皇叔为民，逼死湘王全家，甚至燕王朱棣将儿子送去做人质，自己装疯都没有让他罢手。
