密函成了塘报，公开抄报给各级官员。而在群臣心里，议和等同于投降，还是向"建夷"投降，于是群情激愤，举世哗然，竟然向各级官员抄报投降的消息，陈新甲就这样卷进了风暴眼中。
崇祯还是想救一把陈新甲的。他把所有弹劾奏疏全部压下，又发布一道圣旨，让陈新甲对此事进行解释。想议和又不想被群臣看不起的崇祯，此举是替陈新甲和自己找一个台阶下。
可惜的是，陈新甲没有领会崇祯的这番良苦用心，"不引罪，反自诩其功"。难道议和投降的锅要让皇帝来背？神仙也救不了你啦！
1642年7月29日，崇祯下令把陈新甲下狱，不到2个月，斩于市。
