在力排众议之后，乾隆皇帝乾纲独断地决定征服西北，乾隆二十年，战争正式拉开序幕。实际上，战争的过程并非如预期那般顺利，甚至是十分艰苦，而且又出现反复。清军在先后击败了以达瓦齐为首的准噶尔蒙古军队之后，以阿睦尔撒纳为首的一些蒙古贵族又出现反叛。这阿睦尔撒纳身份比较特殊，此人乃策妄阿拉布坦之外孙，又是厄鲁特蒙古辉特不台吉。因为与达瓦齐之间的利益纠葛，开始依附清廷，也成了清廷平定准噶尔的向导加急先锋。
乾隆皇帝通过一系列的战争，西北地区正式成为大清王朝版图一部分，这是之前王朝仅对西北是名义上的管辖，绝非可以肩比之的。尽管在战争过程中，乾隆皇帝出现过很多失误，甚至是一些残忍的决策，但仅就维护国土的统一，乾隆皇帝作为时代的统治者，确实值得后人称颂。
