玄武门之变的前夜，李世民便是在他家饮宴，并亲自护送李世民回府。至于他有没有参与政变，史书未提。但李世民确实没有亏待他，证明他至少是站在李世民这边的。
李世民登基后，与群臣一同议定开国功臣的爵位食邑。李神通对武将的排位没意见，却对房玄龄、杜如晦等文官的封赏很有意见。李世民则把他败给窦建德、刘黑闼的丑事都给抖了出来，这才让他老实。
李神通死于公元630年，时年五十四岁。李世民让他配享李渊庙庭，追赠司空官职，谥号靖。这位李唐家的大侠，打仗虽然差点，但很会做人，而且每次都能站对队伍，也算是不虚此生了。李神通死后，十个儿子七个封王。
道彦，胶东郡王；孝察，高密郡王；孝同，淄川郡王；孝慈，广平郡王；孝友，尚书左丞、河间郡王；孝节，灵州都督、清河郡王；孝义，胶西郡王、司农卿；孝锐，盐州刺史。孝逸，给事中、梁郡公。孝廉，越州都督。
