乾隆驾崩后，田黄三联章便一直被各代皇帝收藏，直到宣统帝溥仪被冯玉祥赶出紫禁城，田黄石三联章就一直下落不明。1924年，冯玉祥发动北京政变，无视之前与清朝签订的《清室优厚条件》，让内阁重新修正条约，废除帝号将清朝皇室全部迁出紫禁城，并驱逐末代皇帝溥仪出宫。
在冯玉祥的压力下，溥仪面对紫禁城内偌大的"家业"，在匆忙之中只带走了少量的珍宝和字画，以及这枚田黄三印章。溥仪在出宫时将田黄三印章缝制在贴身衣物中，夹藏带出宫外。因为体积小，隐藏又极为隐蔽，再加上一路上溥仪又对它十分爱护，所以田黄三印章保存十分完好。
在战犯所接受劳改，溥仪后来将其上交
1945年，随着满洲政权的覆灭，溥仪在前往日本的途中被苏联红军逮捕，后被囚禁于伯里45号特别监狱里，虽是在监狱里，但苏联方面依旧给了这位清朝曾经的皇帝一些特权，例如可单独用餐，甚至不用参加劳动等。然而苏联给的这种特权，给了溥仪希望，他多次上书苏联表示自己愿意永远留居苏联，请求加入苏联（也有人猜测溥仪的这种行为是怕回国后接受审判），但苏联拒绝了溥仪的请求。
