嘉靖二十七年(1548年),浙江巡抚朱纨率兵攻破了许氏海商集团的大本营宁波双屿港,击溃了这一海商集团,许二逃往西洋。王直等人侥幸逃脱。由于王直平日里素有谋略,经常出谋划策,很为部下折服,故重新组成了一个海商集团。他们便迁到舟山群岛附近的烈港,把那作为走私贸易中心。
除王直外,此时的浙江海面上还有一个以陈思盼为首的海商集团,他们以横港为大本营,与王直进行抗争,王直的船队经过横港时,屡遭陈思盼部下的抢劫。王直为消灭对手,扩大本集团势力,一直在寻找机会打击陈思盼。嘉靖三十年(1551年),机会终于来了。就在陈思盼过生日大宴宾客的那天晚上,乘其戒备松懈,派人内外夹击,杀死陈思盼,擒获其侄陈四,陈思盼之余党见大势已去,纷纷归附王直。从此,王直集团的势力大大增强,完全取得了浙江海面的控制权。
王直成为浙江沿海最大的海商后,极力拓展海外贸易。五六年间,王直积累起的资产已不可胜计;国外商人都信服于他,称他为"五峰船主"。远方商贾闻知他的大名,纷纷来到他的基地从事商品交易。王直虽已成为财多势大、人众船多的海商集团首领,但他并不想与明朝政府相对抗。在杀掉陈思盼之后,他本想以此除贼之功作为条件,请求明政府允许他在海上从事合法的贸易活动。但顽固执行闭关政策的明政府,不但不答应他的通商互市的要求,反把他视为海盗,派总兵俞大猷"驱舟师数千围之"。王直拼死冲出重围,逃往日本,在萨摩州之淞浦津建立了新的贸易基地。
