董家力量虽被何进兄妹铲除，但是他们却还有一个敌人没有消灭，就是宦官集团。由上面何氏兄妹对付董家的做法看，虽然算不上高明，但总算是有决断，所以取得了成功。不过，在对付宦官集团时，兄妹二人的意见则产生了分歧，突显了他们见识的浅薄和优柔寡断的特点。由于何太后从前在宫中时，曾因毒害皇子刘协生母王荣而险遭废黜，当时幸亏宦官们坚决劝谏汉灵帝，才使她躲过一劫，所以，何太后对宫中的宦官并不仇恨。但何进却因宦官想按照汉灵帝遗命支持刘协称帝，而对他们很不满，同时也不想让宦官们分权，所以他坚决要除掉蹇硕、张让、赵忠、段珪等首恶太监，这些人见董太皇太后倒台后，就央求何太后庇护，于是兄妹二人产生分歧。
后来，何进借宦官内讧之际杀掉了蹇硕，袁绍劝何进再进一步将其余宦官也都一并除掉，何进开始也同意这么做，但他又想与何太后商量，试图让何太后下令除掉那些宦官，何太后却不同意，并且宦官们还偷听到了二人密谈的内容。就在何进犹豫不决，不知怎样进行下步计划时，昏了头的何进竟召董卓率兵入京对付宦官。随着形势的发展，宦官们认为马上就要没命了，所以他们趁何进再次入宫见太后回返的时机，将何进骗到嘉德殿，多人一起动手将其杀死，并斩下头颅，向外宣称大将军谋反。
何进一死，洛阳城顿时乱了起来，何进手下的袁术等人，纷纷率兵到皇宫捉拿宦官，导致皇城大乱，何进部将吴匡怀疑何苗与宦官通谋，将其杀死于朱雀阙下。待董卓来到时，正好收拾残局，宦官们已死，何进势力崩溃，只剩下汉少帝与何太后孤儿寡母。董卓以血腥手段迅速控制了京城，控制了皇帝和太后。最后他废少帝改立陈留王刘协为汉献帝，并毒杀了愚蠢的何太后。
