皇太极去世时，孝庄还很年轻。而皇帝一死，剩下的便是他们孤儿寡母了。俗话说："寡妇门前是非多"，在得到多尔衮支持之后，福临继位，孝庄和多尔衮之间就生出了很多故事。甚至在大多数人的认知中，孝庄最终是下嫁了多尔衮。
太后下嫁摄政王一事是否存在，史学界尚有争议。太后下嫁之说，最早引起史家关注的是明遗民张煌言的十首《建夷宫词》，其中有一首说："上寿觞为合而尊，慈宁宫里烂盈门。春宫昨日新仪注，太礼恭逢太后婚"。
主张太后下嫁说的还有其它一些论据：其一，多尔衮尊称为"皇父摄政王"；其二，据蒋良骐《东华录》记载，诏告多尔衮的罪状中，不仅有自称"皇父摄政王"，还有"又亲到皇宫内院"；其三，孝庄遗嘱康熙不要将其与皇太极合葬，是否因下嫁多尔衮而有难言之隐。
然而，在《清史稿》的记载中，孝庄在弥留之际时特意嘱咐康熙说："太宗山陵奉安已久，不可为我轻动，况且我心中也舍不得你们父子，就将我在你父亲的孝陵附近择地安葬。"也就是这样，孝庄最终没有葬入皇陵。
