此时的汉灵帝慌了，急忙派人领兵镇压，但此时的黄巾军势头正盛，又启示仓皇间组织起来的军队所能应付的？于是在初期的多次较量中，官军始终处于下风。
好在名将皇甫嵩等人沉着冷静，采取了避其锋芒等待战机的策略。功夫不负有心人，由于黄巾军将领多是农民出身，较为缺乏军事经验，竟然在草木丛生的地方驻兵扎营，于是皇甫嵩趁夜纵火，大败黄巾军。
但此时黄巾军人数仍十分庞大，官军与之相比十分悬殊。此时倘若黄巾军一鼓作气，灭掉官军，或许历史就会被改写。可惜的是，此时南阳的黄巾军虽然已经壮大到了十几万人，却未乘胜追击，给了官军极为宝贵的休整时间。
在一次针对黄巾军的埋伏战后，官军与黄巾军的力量对比发生了变化，官军开始了由守转攻的战略变化。这直接导致被困于宛城的黄巾军，最终因孤立无援，而走向灭路。公元184年11月宛城收复。
