他在登基之后就立刻在全国范围内掀起了一场轰轰烈烈的"反贪官"运动，直接指向了中央到地方的各级贪官污吏。
首先，他对贪污六十两银子以上的官员都下令处死。他诏令天下："为惜民命，犯官吏贪赃满六十两者，一律处死，决不宽贷。"
并且他严令规定从地方县、府到中央的六部和中书省，只要是有贪污的官员，不管其品级之高低，决不会心慈手软，一查到底。
其次，他还从自己身边大官员开刀，因明初的中书省下属六部中，还留有大量元朝的旧官吏，以及一些跟他一同造反建立明朝的功臣。因其特殊性，他们贪赃枉法可以说是有恃无恐。于是朱元璋对这些官员进行大幅度的惩处。
