当时的云南，民族情况复杂，当地土司的管理方式和其他诸省是有很大区别的，当地的土司经常仗着自己地势险要起兵作乱，对此，历代黔国公的态度都是坚决的，军事打击，坚决镇压任何的反叛者。同时，沐氏在土司互相的争斗中居中调停仲裁，在当地赢得了很大的威望，为大明西南的稳定立下了汗马功勋。
然而，大明后期，农民起义不断，东北的女真部落崛起，时时威胁着辽东的安全，崇祯十七年，李自成攻破北京，崇祯皇帝自杀，当时的黔国公沐天波和云南巡抚商议，调军队镇守云南，并且接受南明朝廷的调遣。
顺治二年，云南的土司沙定洲趁着纷乱的时局起兵造反，率领军队攻入黔国公府，沐天波措不及防，只好带着几名心腹卫士逃出府邸，沐天波的母亲、妻子、弟弟都在这场变故中遇难。
顺治八年，李定国迎接永历皇帝进入云南，此时的沐天波由于世代功勋已经成为了百官之首，但是他觉得沐氏已经深受皇恩，无以为报，坚决拒绝了皇帝的赏赐。
