王寻和王邑正在思索着下一步的计划，根本没有想到兵少的刘秀竟然敢主动出击。仓促之下，新军的前沿阵地被这几千名猛士冲破了好几个口子。
新军虽多，但几十个将领下达的阻击命令都不一样，一时间不免有些慌乱。王寻抽出了一万多兵士前去迎战刘秀，然后给其余的部下下达了不许擅自出击的命令。新军中的很多人都是被新朝强行拉来的壮丁，根本不想和新军同舟共济。因此，听了王寻的命令，他们也乐得站在一旁观战。
这时，留守昆阳城的汉将王凤打开了城门，率领着一批人马前来助阵。而在一旁观战的新军以没有接到命令为名，对王凤的这支军队没有进行任何的阻拦。就这样，刘秀和王凤对王寻进行了前后夹击。王寻作战虽然勇猛，但前有刘秀，后有王凤，他只能且战且退。
这时，他才意识到了自己命令的失误，想要赶紧令大部队加入战斗。但是，刘秀手疾眼快，抢先冲入敌阵将他斩杀。看到主帅被杀，新军顿时乱成一片。王邑斩了好几个临阵脱逃的士兵，但还是无法将令兵士镇定下来。也许是上天也要帮助刘秀，没过多久，本来晴空万里的天空竟然响起了轰隆隆的雷声。然后，在狂风的呼啸中，大雨倾盆而下。
昆阳城附近的几个河流随之决堤，突如其来的洪水顿时将几十万新军淹没。王邑自知大势已去，便急忙率领着亲信逃向洛阳。
