但是马皇后也不是什么事情都亲自管，她心思缜密，任何事情都把朱元璋放到第1位，从来不出面干预朝政，但是会处处留心朱元璋在政治上的得失，有问题她都会婉转的劝诫，而且朱元璋一直非常在意她的建议。
马皇后非常关心民间疾苦，她建议朱元璋设立预备仓，在灾荒之年，做赈灾之用。
当了皇帝以后，朱元璋性格变得暴躁，经常会妄动杀机，每当关键时刻，马皇后都会出现，她劝说朱元璋，作为一国之君，不能因为自己一时的高兴或者愤怒，给予一个人奖赏或惩罚，一个人生气的时候做的决定是不理智的，为了不冤枉任何人，只有把他们交给司法机关，才能得到公正的判决。朱元璋听了马皇后这番话以后，心思也逐渐变得复杂起来。
