晚年生活，以及荣光之葬
建武十三年正月（公元37年），天下大定，吴汉回宛城，奉诏令祭祖。
建武十五年（公元39年)，曾经的匈奴残部南犯。于是吴汉率军北击匈奴，把雁门、代郡、上谷官吏人民六万余口，迁徙安置到居庸关、常山关以东。
建武十八年（公元42年)，蜀郡守将史歆在成都谋反，自称大司马，进攻太守张穆。主要原因就是因为之前的吴汉屠城让蜀地对东汉政府极其厌恶。吴因也因屠城成为其一生的污点。
刘秀因史歆曾是岑彭的护军，精通军事，所以派遣吴汉率领刘尚及太中大夫臧宫率万余人前往讨伐。吴汉进入武都，征发广汉、巴、蜀三郡兵围困成都。后成都城破，史歆被杀。吴汉乘筏沿江而下巴郡，杨伟、徐容等惶恐解散，吴汉杀其大帅二百多人，将其党与百家迁徙到南郡、长沙。
