这两种说法，可能性都不高，但第三种说法得到了不少历史学家的认同，陈寅恪和傅斯年先生也认同此种说法。这种说法就是朱棣是碽妃所生，而不是马皇后和高丽妃子。我们知道，明朝最初的国都是南京，后来定都北京，南京成了陪都。即使是陪都，也有一应朝廷机构，比如太常寺。太常寺主管宗庙礼仪，皇家太庙和祭祀等事务都由它来负责。明末礼部尚书钱谦益对朱棣生母是谁这个问题很感兴趣，在南明时期，他调取了南京太常寺的档案。
档案中对明朝历代帝王的供奉牌位顺序有着详细记载，朱元璋的牌位朝南，左边是李淑妃等妃子，而右边是一个单独的牌位，正是碽妃。牌位顺序在宗法礼制中是有讲究的，太常寺作为主管这一方面的机构自然不会犯错误。那这里面就有点不对劲了，这碽妃到底有什么特别之处？钱谦益联想到了朱棣身上，为了确定此事，他特地去了朱元璋的陵墓，即明孝陵。果然碽妃的牌位单独摆在右边，这样一来，朱棣的身世已经浮出水面。明末学者谈迁也说碽妃就是朱棣生母，只不过因为朱棣自称是马皇后所出，史官不敢违背皇命，才在宗谱上这么写了。近代学者陈寅恪、吴晗和傅斯年等人，经过考证后也支持这一说法，认为朱棣是碽妃所生。
