幸亏辅臣朱轼很了解孙嘉淦的为人，他连忙对雍正说："孙嘉淦虽然狂妄，但我很佩服他的胆量。"雍正其实也非常了解孙嘉淦这个人，他确实是难得的清官，过了一会儿，雍正大笑道："朕亦佩服他的胆量！"然后将孙嘉淦升任为国子监司业（从4品下官员）。
得到了雍正的认可，孙嘉淦的胆子是越来越大，三天两头就给雍正纳谏，总是把雍正气得够呛，但幸好言语句句真挚，且孙嘉淦做事认真，雍正一路给他升职加薪，最后成了顺天府尹（正3品），孙家上下一片喜庆，但乐极生悲的是孙嘉淦的父亲去世了。
按照规定，孙嘉淦必须回乡守丧几年方可归京，但雍正竟然舍不得他离开自己，孙嘉淦刚回去几天就把他强行召唤回京，同时担当工部侍郎等3个官职。
