朱棣先后将黄子澄、齐泰等人诛杀并灭族，之后派人将尹昌隆抓来处置。朱棣都没想过要审问尹昌隆，就直接下令将其全家处斩。在此危难之际，尹昌隆立马想起自己当初写的那份奏折。
史书记载："将就刑，当陛下大呼：'臣曾上奏劝以位让陛下，奏牍尚存，可覆案也！'"就是说刚要行刑的时候，尹昌隆就对朱棣大喊，说自己曾写过一份奏折，建议朱允炆将皇位让给朱棣，而这份奏折应该还在，可以派人查一下。
于是朱棣派人去查，果然找到了这份奏折。朱棣看后，随即下令放了尹昌隆全家，还升任他为左春坊左中允，后来还让他辅佐皇太子朱高炽。就这样，尹昌隆凭借一份没有递上去的奏折，救了全家性命。
之后，尹昌隆一直得到朱棣的重用，可惜因为他性格太过耿直，所以得罪了吏部尚书吕震。在吕震的陷害下，尹昌隆全家被杀。直到吕震死后，他才沉冤昭雪。
其实按照尹昌隆这样的性格，是很难在官场上混的。当初他能够得到朱棣重用，还是全靠那一份奏折。因为一份奏折，他保住全家性命，最后却因为自己的性格，再次害了全家性命。
（参考文献《明史》）
