在伍连德等清朝医学专家的建议下，清政府及各地区负责人对鼠疫采取了科学有效的医学防御措施，比如组建各级防疫组织，以便对疫情进行实时监控并快速采取措施、颁布各类有关防疫的规章制度，甚至采取了交通管制--封锁东北、对感染者和类似感染者进行隔离、对感染区进行消毒等相当现代化的措施。
并最终发现了病源--西伯利亚旱獭。
在此之前，医学专家们一直怀疑这场瘟疫是由老鼠传播的，可是在感染区抓的的老鼠身上又没有发现鼠疫杆菌，但其实旱獭是啮齿类动物，算起来也是老鼠大家族的一种。
然而抗击疫情的过程也并不顺遂，伍连德出于消毒的考虑下令"焚尸"。中国自古推崇入土为安，对照这样的传统观点，"焚尸"可谓是大逆不道。伍连德的请示送到京城，外务部部长那桐就把奏折猛地一摔，甚至对伍连德破口大骂。
关键时刻，一人挺身而出："烧！天塌下来我顶着！"他这一开口，所有人就都无话可说了。此人，正是当时大清实际最高统治者，摄政王载沣。这也是他短促的政治岁月中，做出的最为明智的决定：为了解决鼠疫，都给我烧！
