故而截止明末，明孝陵保存的都十分完好。然而明亡之后的数百年，明孝陵依然稳如磐石，虽无数盗墓贼觊觎，却无一人能得手。明孝陵何以能坚如磐石，深埋山体中的地宫又有何玄机？1961年，考古界学者齐聚明孝陵，对整个墓地陵园形制展开全面的勘测研究。
经过数年的努力，考古界确定，明孝陵地宫之上的宝城虽然因地基沉降山水渗透等原因，出现了墙体坍塌及撕裂的情况，但宝城之下的地宫确实完好无损，没有任何成功打通的盗洞。相隔36年之后，也就是1997年，考古界再次启用最先进的物探技术，专门对地宫进行了精准探测，历时6年终于揭开了孝陵地宫深埋的终极秘密，震动了整个考古界。
亲临现场的学者都慨叹朱元璋真是盗墓者的克星！原来在勘测中学者发现，明孝陵地宫看似沿袭汉唐旧制以山为陵，实际上却来了个大创新！古时候所有以山为陵者，均是由上向下开凿，达到所需深度后再左右延伸，开凿墓室。而孝陵地宫截然不同，是从山体一侧择取一点横向深入，这意味着任何从上向下挖掘的盗洞都不能成功。
而墓道也十分诡异，不正冲墓室，也不是直道，而是侧向迂回深入，极为曲折复杂，非物探技术找不到墓道。更神奇的是，朱元璋似乎对盗墓贼的手段了如指掌，整个墓室周围除了环绕巨石之外，上方和两侧均包裹厚厚的细沙层和巨量碎石层，此二者层层交织，看到这里摸金校尉该头疼了。
