鉴于刘秀的制度设计，和东汉中后期的宦官外戚乱政事实，有人认为正是刘秀设立尚书台架空了三公才导致这一后果，个人觉得这是强加因果。
另一方面，上面已经说到，刘秀的这一设计不过是一次普通的皇权相权之争，其实他所设计的尚书台和汉武帝的内外朝制度、后来的三省六部制度乃至明代的内阁、清代的军机处并没有什么两样，只不过名字不同而已。都是皇帝为了分割相权采取的一些措施，无非是任用自己亲信的人另外再建立一个平台绕过丞相那班人来处理政务而已(也就是所谓的内朝)。
非要说说东汉的宦官外戚乱政和这个设计有关的话，就是这么一点:皇帝为了防止尚书台的人权力过大威胁自己，故意把尚书台的长官的级别压低，造成一种级别低权力大的局面，从而防止他们权力膨胀(但这一点古代皇帝做法是一致的)，比如尚书令食不过一千石，远远比如宦官外戚，所以他们后来才会沦为宦官外戚的工具。
