朱儁幼年丧父，早年贫苦，因为剿灭交趾叛军而起家。黄巾之乱爆发后，朱儁与皇甫嵩一起剿灭颍川的黄巾军。
但朱儁点有些背，他首战就败给了黄巾军猛将波才。后来皇甫嵩用火攻破敌，朱儁乘势对黄巾军追击，杀敌数万人。
随后，朱儁调兵进攻黄巾军重兵拒守的宛城。为了迷惑敌人，朱儁在城外堆起了土山，并每天派人上山观望城中情况，他们不断摇旗呐喊，营造出了要从此地攻城的假象。同时，朱儁却声东击西，率兵五千从黄巾军防备空虚的地方攻入，逼降了黄巾军残部。
其后，黄巾军复叛，他们同心死战，让朱儁一时一筹莫展。于是，朱儁又故意解围，让里面的黄巾军以为围困解除，突然松懈下来，并开始出战突围。朱儁利用黄巾军的破绽，大举进攻，彻底消灭了南阳的黄巾军势力。而后，朱儁拜右车骑将军，封钱唐侯。
皇甫嵩、卢植和朱儁，是《三国演义》里率先登场的三位名将，他们不仅战功赫赫，也与三国中的主角有诸多交集。比如，皇甫嵩曾经提携过后辈曹操、孙坚等人，而卢植更是刘备的老师。
只不过，三人都在"董卓之乱"后或死亡，或销声匿迹，无法成为三国这部大戏戏份较多的主角之一。
