然而，窝阔台尚未正式册立失烈门为储君，便因酒色过度暴崩于谔特古呼兰山的行营当中，时在淳祐元年（1241年）十一月。窝阔台死后，失烈门接班的计划被打乱，而乃马真后为了把儿子扶上汗位，竟不顾宰相耶律楚材等人的反对，悍然宣布临朝摄政。乃马真后上台后，大肆笼络诸王、朝臣，要求他们拥戴贵由即位，并收到积极成效。
乃马真后画像
淳祐六年（1246年）八月，除与贵由不和的拔都称病婉拒参加忽里勒台（蒙古诸王大会，多用于推举大汗、决定征战等大事），其他诸王均拥戴贵由即位，后者由此成为蒙古帝国第三任大汗。贵由登基后，乃马真后虽然宣布归政，但依旧在幕后操控朝政，直到同年底病死后，贵由才开始掌权。然而，贵由施政时照搬母亲的做法，完全没有主见，堪称最没有存在感的大汗。
乃马真后执政期间，摒弃成吉思汗制定的《札撒》（法令总集），随意变更法度，并大肆清洗朝中老臣，任命一群不学无术的亲信担任要职，由此导致朝政败坏。与此同时，乃马真后为笼络诸王，还大肆封赏诸王，赐予他们各种特权，由此导致帝国上下号令不一、矛盾重重，使帝国近乎走向奔溃。以上种种糟糕的局面，急需贵由进行拨乱反正。
