虽说清朝自恃海军实力比意大利更胜一筹，但他们丝毫不敢马虎。清政府命两江总督刘坤一做好迎战准备，同时又启用叶祖珪、萨镇冰等前海军将领，做好备战准备。意大利也不甘示弱，他们派出三艘军舰到中国沿海巡航，大有战争一触即发的态势。
1899年5月30日，清政府命令所有北洋军舰出海，日夜巡逻。看到清政府没有退让的意思，第二天，意大利就宣布放弃对三门湾的要求。但清政府怀疑这是意大利故意使诈，丝毫不敢松懈，命海军继续加强沿海地区防守。同年12月20日，清政府命令叶祖珪率北洋诸舰南下，此次事件才算平息下来。
这是中国近代史上少有的一次外交胜利，究其原因，是清政府自恃海军舰队实力强于意大利的远东舰队，所以才敢强硬回应。通过这件事，清朝大臣们也认识到海军在国防上的重要性，因此支持海军建设的呼声渐渐高涨，清朝的海军实力也得到一定程度上的提高。
为了展示大清帝国的海军实力，1910年，英国国王爱德华七世去世，乔治五世继位的时候，清政府派出当时中国最大的军舰--海圻舰前往哀悼和祝贺，并参加了英国国王的加冕观舰仪式。访英途中，清政府顺便派该舰访问墨西哥和美国。
