此时的北京，不过是清朝在关内的一个据点，它三面临敌，处境危险。然而，多尔衮却毅然于1644年将首都迁到这里，让顺治在北京重新登基，宣布"兹定鼎燕京,以绥中国"，从这时候起，清朝的性质开始发生了巨大的变化。多尔衮为崇祯举行了厚葬，安抚明朝旧官僚势力，并废除了明朝的苛捐杂税。很快清朝就占据了山西、河北、山东等地，李自成被迫退居关中自保。清朝在北方的统治开始稳定下来。
清军开始入关
二，削平群雄
李自成虽然退出了关中地区，但是还占据北方一半的土地，拥有几十万的大军，不可小觑。多尔衮于是选择全力先灭李自成，他派遣两路大军，一路从潼关正面进攻，另外一路从从山西渡过黄河进攻榆林。在两路大军的夹攻之下，李自成很快兵败，被迫放弃西安，退入襄阳。1645年初，李自成击败了南明将领左良玉，占领武昌，并试图攻陷南京。然而就在李自成立足未稳之时，清军已经到达了湖北，李自成在九江之战中再次战败，最终在湖北通城县被地乡勇杀害。李自成去世后，"大顺"政权随之瓦解，残余势力转战东南，和南明势力结合了起来。李自成兵败后，整个北方已经被清朝占据。
