嘉靖皇帝名字叫朱厚熜，按照正常状况下他是没有可能继承皇帝的。不过明武宗朱厚照去世之后没有子嗣，所以要在王子里选一个当皇帝，最后选中了朱厚熜。当然，这是明武宗生前制定的，并不是大臣选的，所以才会有后面的矛盾。朱厚熜是明宪宗朱见深之孙、明孝宗朱祐樘之侄、兴献王朱祐杬之子、明武宗朱厚照的堂弟。这一下成为了皇帝，可以说是天大的喜事。不过事情发展得并不顺利。
朱厚熜在进京当皇帝的时候和大臣们有了矛盾。在朱厚熜及使团到达北京城外的良乡时，双方发生了第一轮冲突。根据杨廷和的安排，要礼部用太子的礼仪迎接朱厚熜，即由东华门入，居文华殿。而朱厚熜要从大明门进，然后举行登基大典，大臣们反对。因为大明门是皇帝才能走的。不过朱厚熜不管这些，如果不让自己从大明门进，自己就不做皇帝了。最后在太后的调和下，大臣们也妥协了。朱厚熜在城门外先登基，成为皇帝后就可以从大明门进入紫禁城。表面上看起来问题解决了，不过朱厚熜却发现一件事，这些大臣看不起自己。因为自己不是皇子，根不红苗不正。如果不彻底解决这个问题，之后大臣们肯定不服从自己。
继位后的朱厚熜就开始为自己正名了，一心想要把自己扶正。即位不久，嘉靖帝与杨廷和、毛澄为首的武宗旧臣们之间关于以谁为嘉靖帝皇考（即宗法意义上的父亲），以及嘉靖帝生父尊号的皇统问题发生了长达三年半的大礼仪之争。嘉靖帝不顾朝臣反对，追尊生父为兴献帝后又加封为献皇帝、生母为兴国皇太后，改称明孝宗敬皇帝曰"皇伯考"。说白了，自己还是自己父亲的儿子，之前的皇帝自己叫大爷，就是不叫吧，不过继给他。
