"贼悬之高竿，丛射杀之，复脔其肉。"
不过，关于周遇吉的死，在民间有另外一种截然不同的说法，据当地的人口述，当年李自成攻打宁武关的时候，确实遇到了周遇吉的顽强抵抗，但是李自成的农民军并没有进行屠城，而是传出了"献周遇吉，一城无死"的消息。周遇吉身为宁武关守将，对宁武关再熟悉不过，这宁武关并非一座孤城，而是一个防御集群，在明朝期间一直用心经营，如果真有战事，应该早有援军至，此刻并没有看到援军的影子，周遇吉已经明白，他被放弃了。周遇吉知道自己必死后，不愿意连累全城将士，并坚决的表示"今岂惜一死以累众，请献我"的意愿，最终，求仁得仁，李自成将周遇吉斩首，也遵守了诺言，并未对宁武关军民进行滥杀。
对于这样的民间说法，自然不会有很多人支持，毕竟与《明史》相悖，直到一位明朝将军墓出土了将军骸骨，这个谜题才算有了真正答案。
宁武县政府对周遇吉墓进行迁葬时，在墓葬底部发现了一具遗骸和铁质兵器座。经过专家考证，这副遗骸正是周遇吉本人的骸骨，在他的头骨枕骨下方，有一道清晰可见的十三厘米长的刀口，由此可见，这伤痕正是周遇吉的致命伤，也就是说，周遇吉并非死于乱箭之下，而是死于斩首。
