突然，有一位大臣答道："我看不妥，以前伊尹、霍光之所以要废立君主，是因为君主无德无能。可现在皇上年纪虽轻，但行为并没有什么过失，怎么能和以前一样的做法把他废掉呢？"
董卓料不到还有人敢站出来反对，不禁勃然大怒，一看原来是尚书卢植。他当即拔出剑，恶狠狠地向卢植刺去，卢植慌忙离席而逃，百官也一哄而散。董卓想趁势追杀卢植，被蔡邕拦住了，蔡邕劝他息怒，容后再议。议郎彭伯也为卢植说情，他对董卓说："卢尚书是全国有名的大学者，威望很高，如果把他杀了，恐怕天下的人都会不服气的。"董卓虽然没有再追杀卢植，但马上下令罢免卢植的尚书官职。第二天，董卓又召集百官在崇德殿议事。他又以少帝在为灵帝守孝期间，没有尽到儿子职责的理由，威逼何太后答应废掉少帝。接着，他又当着百官的面，诉说何太后逼死董太后的罪状，责令她三天之内迁居永安宫。何太后吓得瑟瑟发抖，只是不断地流着眼泪，一声也不敢争辩。随即，14岁的汉少帝刘辩被解下玺绶，向9岁的弟弟刘协跪拜称臣。
而刘协这位被董卓拥立的新君就是东汉王朝的最后一位皇帝汉献帝。从公元189年到220年，刘协共做了31年皇帝，然而自始至终，他徒有天子之名，而无至尊之权，在一个又一个的权臣手里充当着愧偏的可怜角色，一直到最后被曹操的儿子曹丕废掉，东汉王朝结束为止三天后，何太后一边哭着，一边骂着，只得迁居永安宫。董卓听到何太后竟敢骂自己是"恶贼"，当即派人逼何太后吃毒药自尽。
接着他不许汉献帝以皇太后的身份来安葬何太后，经过汉献帝的一再哀求后，他才仅仅同意可以与灵帝合葬。董卓余怒未平，下令将何苗的棺材掘开，将尸体斩为几段，抛弃在大道上，又将何苗的母亲杀掉，剥光衣服后丢在乱草丛中，不许人去收尸，借此来发泄对何家 的愤恨。
董卓生性残忍，但非常狡猾。他看到天下人都非常痛恨宦官擅专朝政，胡作非为的劣行，为了缓和统治阶级的内部矛盾，收揽人心，维护其统治，他装着一副"仁政"的样子，对官僚地主中的一些名士加以笼络。他宣布为宦官所迫害而死的陈蕃、窦武等人平反，恢复他们的官爵，专门派人到他们府上去吊祭，还提拔他们的子孙为官。他还任用了当时的一些名士如周橙、郑泰、荀爽等人为官，甚至还授予司空、州牧、州刺史这样的高官，而自己的亲信都只担任将校，不担 任重要官职。更煞有介事的是，尽管他对袁绍恨之入骨，但这时还装着大度样子，遥拜袁绍为渤海郡太守。他还加封袁术为后将军，曹操为骁骑校尉等等。但袁术、曹操知道董卓面不似心，非常残暴，都偷偷地逃离了洛阳。
