因当时的技术太过落后，在挖掘出大量的明朝文物、资料的同时，也造成了很多挽回不了的损失。经过一年得仔细探查，郭沫若带领的考古队的队员才发现了定陵的门在哪里？考古队员们在半年后才找到了一堵高八点八米，厚一点六米的汉白玉雕成的石门，这里就是地宫的入口。为了打开这个石门，当时的考古队员们花费了很大的功夫，其实这个石门巧妙的使用了自来石，一旦被关上之后就很难打开。
开启墓室大门时，忽然间，一股刺鼻的黑气崩出，把大家吓坏了，因为担心定陵地宫里有尸气或者是缺少氧气，考古队员们只能先放鸡进去做实验。定陵的挖掘十分困难，挖掘进度十分缓慢，一直到1958年的7月，定陵的挖掘工作才基本完成。
考古队员们发现，万历皇帝的定陵在之前已被盗过数次，部分文物已经被毁坏，再加上当时的考古技术落后，密封的空间有空气进入之后，里面的字画、绸缎一类的文物就被迅速地腐化了，更有甚者，万历皇帝和两位皇后的金丝楠木棺材居然被考古队员们当成垃圾扔了。但是此次挖掘，还是有很大的收获，考古队员们从定陵中挖掘出土的文物，大约有三千多件。
