当然，当时太平军打仗是最主要的工作，所以他有时候也打打仗，但是似乎他带兵打仗的本领不怎样，所以败多胜少，甚至还被降职，打入监牢！不过这小子运气确实好，很快又被放回来了，为啥呢？因为读书人实在是太稀缺了，他之前一直为洪秀全和杨秀清写诏书，批阅奏章，所以洪杨这两个一号二号人物离不开他！1853年，太平天国打下了天京城，结果这帮没见过世面的领袖们就开始迅速勾心斗角起来，尤其是天王和东王的矛盾越来越尖锐。这个时候曾水源是东殿的官员（他的官位很高，是天官正丞相，统管东殿，可是说是东殿二号人物了）。
但是嘛，他的好运很快也就到头了，最终甚至连命都丢了。但他的死法实在是令人哭笑不得：1855年的一天，一个东殿的宫女嚼舌根，说东王若升天，你们为官的都难了''。但这位仁兄不知道是脑子哪里不对，竟然没把这件事情告诉东王，这就是大问题了。结果杨秀清怀疑他不忠，这个"天父上升"的借口把他给杀了，同样倒霉的还有东殿吏部尚书李寿春，这段剧情在央视版电视剧《太平天国》有所修改，电视剧中把曾广源作为了东王和天王的矛盾焦点也描写。
1953年，南京发现了曾水源的坟墓，这个坟墓很奇怪，正中题「天朝元勋曾水源之墓」，左书「太平天国己未九年六月吉日重修」，知道重修是啥意思吗？是杨秀清死之后给平反了的，也就是说，他刚死的时候是犯人的身份。
