然而，与明朝的不作为管理形成鲜明对比的，则是清朝的直接管理。
到了清朝时期，其领土范围已经扩张到了黑龙江地区，且在这些新的领土上都设置了管理官员，实现真正的政治管理，这是明朝无法比拟的。同时，在清朝时期，国家不仅在偏远地区派遣了驻军，设置了官员，同时，还对当时的一些"外夷"地区，也实行了人口入户，征粮纳税，并派兵进行巡边。
当时，朝鲜等一些境外国家，如果有偷渡者或者偷猎者在边境进行侵扰，清政府都是采取严惩不贷的态度加以打击。朝鲜就曾出现过类似的情况，清政府甚至要求朝鲜国王给大清写信道歉，足见大清的天威。此外，还出现斩杀过境人员，惩治外国官员的情况，足见清政府对这些地区管控的严格程度。
正因如此，使得清政府对于边境的统治和管控更牢固、更稳定。由此，可以看出在明朝时期，其直接管辖的领土面积并不大，对于东北等偏远的地区，采取的管理也多是通过设立"奴儿干都司"，来获得这些地区对朝廷的进贡，并没有在实际的管辖层面上下功夫，更没尽到一个国家统治层应尽的责任。
