这事儿越闹越大，不得不奏报朱棣。朱棣闻讯大怒，立即派大将柳升率领京城的军队前去镇压。大军临行前，朱棣还亲自安排方略，要求柳升"断其汲道，防其逸走"。
柳升到达青州后，包围了山寨，眼看大势已去，唐赛儿诈降，趁官军不备，连夜突围。从此以后，唐赛儿不知所踪。唐赛儿的起义军完全被镇压下去。
事后，山东一些官员全被朱棣治罪入狱，因为他们管理不力，才使得唐赛儿势力崛起。镇压有功的柳升也被入罪，因为他最终没有抓住或者杀死唐赛儿，而是让她跑掉了。
当时有传言说唐赛儿逃跑后削发为尼出家了，也有说做了道姑。根据朱棣的性情，绝不可能放过他的敌人的，建文帝下落不明后他也到处寻找，一定要斩草除根。所以，朱棣命令将山东、北京境内的尼姑、道姑全部逮起来审查。
