1218年4月开始了东征的第二阶段，德国皇帝派来了由骑兵、城市雇佣军和荷兰伯爵威廉率领的底地部队组成的援军到达巴勒斯坦的阿克城。他们不打算冒风险进攻耶路撒冷而是进攻穆斯林的大后方--埃及。如果能摧毁穆斯林阿尤布王朝在埃及的宫廷，那么阿尤布王朝将大乱。恰好十字军以前的对头--罗姆苏丹国非常忌惮阿尤布王朝的扩张同时也厌倦了和十字军的冲突，因此突厥人同意南下叙利亚进攻阿尤布王朝的城市。
8月十字军沿着尼罗河逆流而上来到杜姆亚特城下，来自教廷的监军阿尔巴诺主教准备接管十字军的指挥权，由此引发的各种扯皮大大拖累了十字军的攻城作业。一个月后十字军开始向城墙发动进攻，阿尤布王朝内部出现内讧，于是苏丹的使节来到十字军营寨议和并提出优厚的条件:归还全部耶路撒冷王国和三十年合约另加三万金币以换取十字军离开埃及，这次议和获得很多十字军将领的同意但被主教监军拒绝了。
主教监军不顾骑士们的反对坚持继续攻城但久攻不下，十字军开始怨声载道，疲惫的十字军放弃了原先的沉稳，进行了一次对阿尤布军队新营地的突袭但阵型混乱遭到阿尤布军队的反扑，突袭遭到失败。城市被围半年多粮食耗尽，阿尤布方希望继续和谈仍被主教监军拒绝了。阿尤布军队首先耐不住性子撤出城内外守军把一座空城留给了十字军。十字军占领杜姆亚特后开始南下进攻开罗，当来到一个干枯的运河边时遭到阿尤布军队的包围，由于埃及夏季尼罗河暴涨原来干枯的运河被灌水开始暴涨截断的十字军的退路，在这里十字军被全歼。第五次东征彻底失败！
