蓝玉人生的顶峰，还是洪武二十一年与北元的捕鱼儿海战役。他所率领的15万明军顶风冒沙，突然杀到元顺帝之孙脱古思贴木儿大营跟前。一番激战，明军俘获元主次子地保奴、嫔妃、公主以下男女将近八万余人，脱古思贴木儿和长子天保奴，仅仅带着几十骑仓皇逃出。
此战过后，北元统治体系被彻底摧毁，忽必烈一脉的黄金家族，再也没有实力能够有效得统合起整个草原的力量，多年以后蒙古逐渐分裂成鞑靼、瓦剌、兀良哈三股势力。
因而，对于蓝玉指挥的捕鱼儿海战役，素来有北元"靖康之变"的说法。
立下如此殊勋，蓝玉也就有了骄傲膨胀的资本。武将身上那股子蛮横跋扈的通病，逐渐在蓝玉身上开始显现。
比如在北征班师回朝的途中，身为统兵主帅的蓝玉，竟然钻进脱古思帖木尔妃子的营帐把她给侮辱了，结果导致她羞愧自尽。
