荷兰军队听说郑成功要来进攻之后，十分恐慌，他们一方面把军队集中在港口的两座城堡中，一方面又将商船凿沉，沉在港口阻止郑成功的舰队登陆。然而，郑成功却趁着海水上涨之时候，顺势把舰队开进鹿耳门内海，并全力进攻两座城堡，切断了城堡与台湾城的联系。可是荷兰舰队仍不死心，他们指挥"赫克托"号战舰在一旁发起攻击。
郑成功一怒之下，命令60多只战船将其团团围住，一起发射炮弹，将荷兰的"赫克托"号战舰击沉。最后，坚守在城内的荷兰侵略被围困8个月之后，终于投降。从那时开始，被荷兰占领38年的台湾再次回到了中国的怀抱，荷兰东印度公司的贸易也在此地宣告结束。
