当时的大都督崔长仁是文献皇后的兄长，因为犯了国法，按照当时的法律是应该斩首的，但是，隋文帝看在皇后的情面上，赦免了其死罪。皇后得知此事，便向皇帝进谏，不能因为私情而耽误了国家大事，不顾家规枉法。隋文帝听了皇后的话，便将崔处死了。
皇后还有一个同父异母的兄弟，因为酗酒殴打百姓致其死亡，因为，之前受过皇后的责骂而怀恨在心，并利用邪门歪术诅咒皇后，按照相关的国家法令，也是要处死的。皇后在得知这个事情之后，也是气的不行，三天都没吃进去饭，但是，最后她还是请求皇上赦免了他的罪行。
皇后说："如果说独孤陀是因为残害百姓而需要被斩首，臣妾是不会过来求情的。但是，现在他是因为冒犯了皇后，诅咒我才要被定为死罪，所以，我才来向皇帝求情，希望能够免除他的死罪。"就这样，陀的死罪被赦免了。
文献皇后也有很好的政治领导才能，每次跟隋文帝讨论国家大事的时候，两个人的想法往往不谋而合，观点也是非常一致的，所以，在宫中常有人称他们为"二圣"。
