曹操曾在饥荒战乱时颁布了禁酒令，但是孔融却几次三番的写信给曹操表示不满，进行反驳，严词之中表现的相当傲慢无礼，曹操征讨乌桓时，孔融又一味挖苦嘲讽，最过分的是，曹操攻下邺城后，听说袁熙之妻甄氏貌美，就想要纳为自己妾室，但是儿子曹丕不知父亲的心思，就抢了个先，将甄氏收归囊中，对面自己的儿子，曹操能说什么？没想到孔融再次写信嘲讽，曹操这次真的是忍无可忍，孔融一而再再而三的与自己针锋相对，出纳不逊，还总是讽刺他，以曹操的性格如何能容忍孔融这种人的存在！
曹操对孔融怀恨在心，但是出于孔融名声过大，一时间不知道如何对他下手，当时有句话叫做"以融名重天下，外相容忍"，不过曹操终于还是等到了机会，建安十三年，郗虑构陷孔融，曹操压抑了很久，终于借此名义将孔融判了死刑，罪名有"招合徒众"欲图不轨，"谤讪朝廷"不遵超仪，"跌荡放言"等等。
孔融死时儿子九岁、女儿七岁，因为当时二人年幼，曹操并未斩尽杀绝。但是后来听手下说了一件事后，曹操改变了想法，手下说当时去孔融家抓捕的时候，孔家乱成一团，但是这兄妹二人不为所动，居然还在专心对弈，曹操手下问孔氏兄妹："你们父亲都被抓了，你们为何就当没看见一样"，妹妹回答："覆巢之下，安有完卵"，她表现的十分镇定，曹操听后打大惊，此女子小小年纪就有这般觉悟，万万留不得，长大后有了才能后，还不得报仇啊？想到这里，所以又命人将孔氏兄妹给杀掉了。
