最后，该条约的签订还有一个副作用，就是使得俄罗斯认为"清准战争"是清朝的平叛战争，而不是两敌国之间的战争。这使得国际上的认知准噶尔的领土就是清朝的领土，这为中国自安史之乱丢失西域一千年之后，再次控制了西域打下了法律基础。从此之后，我们就可以理直气壮的说"自古以来"了。
清朝做出了让步的妥协
就《尼布楚条约》签订后所确定的事实来说，中方自然是亏损了的，因为中俄双方所谈判的内容：远东东北亚领土归属问题，从中方来讲是没有疑问的，因为这些地方自唐朝起就属于中国，自唐代起中国政府就在远东地区设立军政一体的统治机构，从8世纪到17世纪900年间历经唐朝、辽朝、金朝、元朝和明朝五代中国政府的管辖，所以这些地方的主权归属是没有疑问的。
