在抵御八国联军的战斗中，由于实力悬殊，京城很快就被联军占领，慈禧携光绪帝仓皇逃亡陕西。慈禧本以为洋人这次定不会放过她，然而，洋人并没有推翻慈禧的念头，这让慈禧喜出望外。随后，洋人列出了一份"索办罪魁"的12人名单，其中载勋的名字赫然在列，并且被指为"祸首"。考虑到载勋的身份，慈禧起初并不想杀掉他，只是将他革职罢官，交由宗人府圈禁。但洋人对慈禧的这一处理并不满意，他们强烈要求杀掉载勋，慈禧不得不于1901年2月13日发布上谕："已革庄亲王载勋，纵容拳匪，围攻教堂，擅出违约告示，又轻信匪言，枉杀多命，实属愚暴冥顽。着赐令自尽……"
在圈禁地，载勋的行动较为自由，并且被允许妻儿陪伴。2月21日，兵部左侍郎葛宝华带着圣旨来到载勋的住处，门外放炮迎接。听到炮声的载勋不明就里，询问随从得知是钦差过境。葛宝华进门后，载勋连忙询问身在陕西的慈禧的情况，葛宝华唯唯否否，接着就出堂四处逡巡，发现了一座古庙，并在里面找到一间空屋。他令手下将白绫悬于梁间，锁上房门。为防止发生意外，葛宝华还调兵前来，他向载勋宣读圣旨完毕后，载勋感叹道：老佛爷也活不了多久了。随后，他与妻儿话别后，悬梁自尽。
其实，载勋的死多少有些冤枉，在某种程度上说，他就是慈禧的替罪羊。在慈禧眼里，只要能保住她的位置，什么都好说，领土她都敢让，更何况是那些大臣。
